Além das Faculdades e Institutos, a Unicamp tem Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa que se destacam pela excelência de sua produção científica.

A interdisciplinaridade constitui atualmente uma das principais tendências da ciência global – e a Unicamp foi pioneira no contexto universitário brasileiro ao investir nesse tipo de pesquisa, que desde a década de 1970 se desenvolve na universidade e vem se fortalecendo através da Coordenadoria de Centros e Núcleos Interdisciplinares de Pesquisa (COCEN).

Atualmente, são 22 Centros e Núcleos em áreas que vão da biologia molecular à música, da nanotecnologia aos estudos teatrais, das alterações climáticas à opinião pública, da inteligência artificial aos estudos de gênero, da transição energética à criatividade humana, da neurociência às políticas públicas, da cibercultura à história da ciência, da química medicinal à meteorologia – apenas para dar uma dimensão da amplitude do sistema.